新型软件支持研究人员的育种决策

发布者:bpadmin
发布时间:2020-05-14 23:08
分类:全部资讯 最新动态 研究报告
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城农获悉——德国哥廷根大学研究人员开发了用于模拟复杂育种计划的软件以支持育种决策。



哥廷根大学(University of Göttingen)的一组研究人员开发了一种创新软件程序,用于模拟育种计划。被称为“模块化育种计划模拟器”(MoBPS)的软件可以模拟动植物育种中高度复杂的育种计划,旨在帮助育种者做出日常决策。此外,该计划旨在成为哥廷根育种研究进一步发展的基石。除了纯粹的经济繁殖标准外,研究小组还在努力实现可持续发展、保护遗传多样性和改善动物福利等目标。这个软件发表在《G3基因、基因组学、遗传学》杂志上。

哥廷根大学综合育种研究中心(Cibreed)的托尔斯滕·布克(Torsten Pook)表示,通过模拟育种计划,可以快速得出关于遗传改良的论断。事实上,近亲繁殖或对动物健康的不良影响等潜在问题可以在早期阶段发现。布克是“模块化育种计划模拟器”的主要开发者。该软件模拟了现实育种中常见流程,如选择、繁殖和数据收集(如DNA信息、性状观察)。同时,它可以在短短几分钟内模拟数百万种具有特定特征的动物育种结果。

布克表示,从模拟简单的玉米育种计划,到增加对马匹骨骼稳定性的考虑,再到过去200年来马鹿种群的模拟发展,一切都可以通过该软件实现。研究小组的下一个目标是为“模块化育种计划模拟器”开发一个额外的模块,可以在给定的条件约束下,自动优化具有大量变量的育种计划。


文章来源: Torsten Pook, Martin Schlather, Henner Simianer. MoBPS - Modular Breeding Program Simulator. G3 Genes|Genomes|Genetics, 2020; g3.401193.2020 DOI: 10.1534/g3.120.401193
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